La biblioteca resguarda un acervo de libros de los siglos XVI al XIX, junto con publicaciones especializadas en arte y diseño, y catálogos de museos y subastas nacionales e internacionales.

Destacan fondos como el de libros antiguos y raros (1484-1799), con incunables, biblias y manuscritos; el de documentos históricos, con títulos de propiedad e informes fiscales del siglo XIX; y el Fondo Conventual, con 420 manuscritos en pergamino de órdenes religiosas. Además, el Fondo Cervantes alberga casi 800 ediciones de Don Quijote de la Mancha en 19 idiomas, incluyendo primeras ediciones e ilustraciones de Gustave Doré.

Si bien la colección original refleja los intereses de Franz Mayer, la biblioteca sigue creciendo con títulos contemporáneos, sumando hoy alrededor de 22,000 ejemplares disponibles para la investigación.